口岸的建设和疫情防控事关边境城市的繁荣和两国贸易的发展。
随着中国－东盟自由贸易区的建成与广西北部湾经济区开放开发，中国－东盟贸易量大幅提升，据统计，2010年1-9月，中国－东盟贸易额达2113.1亿美元，同比增长43.7%。温家宝总理在第十三次中国与东盟领导人会议上提出要进一步深化中国－东盟经贸合作，力争2015年双方贸易额达到5000亿美元。
广西作为中国与东盟经贸合作的桥头堡，这意味着再过5年广西边境贸易量及出入境人员将成倍增长，届时边境口岸的查验设施、通关能力及疫情防控能力将面临严峻考验。如果口岸配套检疫查验设施跟不上贸易发展的步伐或者在大物流、大通关背景下，因口岸防控不力而引发口岸重大疫情，导致国家强制封锁口岸、暂停贸易，这将对边境地区的稳定与经济社会发展造成严重影响。
为此，我区必须提升边境疫情防控能力，有效地服务与促进广西经济社会又好又快发展。而要提升边境疫情防控能力应该做到以下几点：
加大边境疫情防控经费投入，将防控经费列入地方政府财政预算，保证防控经费到位；加强口岸查验设施建设，提高防控能力。主要是加强口岸进境水果、种苗、木薯类产品、水产品等大宗农产品配套查验设施建设和检疫实验室建设，提升口岸检疫能力，争取广西有更多的口岸通过国家考核成为进境水果、植物及其产品指定口岸，为边境农产品的贸易创造条件。
开展中国－东盟主要贸易动植物及其产品的检疫风险分析，在确保安全卫生的前提下，加快检疫通关速度，促进贸易便利化；建立省级、市（县）级二个层面的联防联控机制，由自治区政府牵头，联合海关、边防、检验检疫、商务、水产畜牧兽医、林业等部门建立省级联防联控机制，建立完善工作机制，边境各市（县）按照省级模式建立联防联控机制；建立非法走私动植物及其产品无害化处理场。组织专题调研，探索非法走私动植物及其产品经检疫合格或无害化处理合格后放行的检疫处理新模式。
加强中国－东盟跨境动植物疫病防控合作。在广西中越边境地区共同建设跨境动植物疫病防控监测站，建设跨境疫情预警信息系统，建立中国－东盟重大动物疫病和植物有害生物信息系统、预警通报系统以及检验检疫法律法规和技术信息系统。建立跨境疫情联防联控机制，无偿为中越边界越南境内30公里内饲养的家畜禽实行全免疫，建立中越边境动物疫病防控免疫带，继续开展与越南实蝇监测合作以及开展跨境人才培训与交流等。